Gregory R. Bowman

Gregory R. Bowman

Greg Bowman, profesor asistente de bioquímica y biofísica molecular en la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington en St. Louis, lidera un proyecto de supercomputación llamado Folding@home, que surgió en el año 2000 a iniciativa de la misma escuela. El proyecto busca desentrañar los misterios de la dinámica de las proteínas, incluido el proceso de plegamiento y sus funciones en la salud y la enfermedad.

Laboratorio de Bowman

Bowman Lab busca comprender la distribución de las diferentes estructuras que adopta una proteína y cómo este conjunto determina la función de una proteína. Los ejemplos de proyectos de investigación en curso incluyen:

1. Comprender cómo las mutaciones en la enzima beta-lactamasa cambian su especificidad sin cambiar la estructura cristalina de la proteína.
2. Designar fármacos alostéricos.
3. Desarrollar algoritmos para construir rápidamente modelos de las diferentes estructuras que adopta una proteína.Para habilitar los cálculos masivos que subyacen a su trabajo, ejecutan el proyecto de computación distribuida Folding@home. Este proyecto empodera a cualquier persona con una computadora y una conexión a Internet para convertirse en un ciudadano científico y acelerar la investigación biomédica mediante la ejecución de simulaciones en su(s) computadora(s) personal(es). El equipo de Bowman utiliza una red informática distribuida para hacer que los problemas informáticos masivos sean más manejables. Un problema complejo que podría ser imposible de resolver en una sola máquina puede dividirse en partes más pequeñas y distribuirse a 1000 computadoras para que lo resuelvan simultáneamente. En la actualidad, más de 200 000 dispositivos participan en Folding@home. También desarrollan métodos de modelo de estado de Markov (MSM), algoritmos de muestreo adaptativo y herramientas de aprendizaje automático para construir de manera eficiente mapas de dinámica de proteínas y extraer información valiosa.

Premios y Reconocimientos

• Premio del Departamento de Ciencias de la Computación a la Excelencia Académica, Universidad de Cornell, 2006.
• Premio Irving Sigal para Jóvenes Investigadores en 2006 por los resultados de su simulación.
• Fue galardonado con el Premio Thomas Kuhn Paradigm Shift 2010 de la Sociedad Química Americana por el desarrollo del software de código abierto MSMBuilder y por lograr un acuerdo cuantitativo entre la teoría y el experimento.
• Premio Joven Investigador, Tecnología del Genoma, 2011.
• Por su trabajo, Vijay Pande fue nuevamente galardonado con el Premio Michael y Kate Bárány para Jóvenes Investigadores en 2012 por el "Desarrollo de métodos computacionales para la creación de modelos teóricos líderes para el plegamiento de proteínas y ARN".
• Premio Burroughs Wellcome Fund Career Award en Scientific Interface del 2013 al 2018.

Libros publicados

1. Bowman GR. "Una descripción general y una guía práctica para construir modelos de estado de Markov" en Una introducción a los modelos de estado de Markov y su aplicación a la simulación molecular a largo plazo. Editado por Bowman GR, Pande VS y Noe F. Springer Press, en preparación.
2. Bowman GR. "Tutorial sobre la construcción de modelos de estado de Markov con MSMBuilder y su granularidad gruesa con BACE" en Dinámica de proteínas. Editado por Livesay DR. Humana Press, 2013.

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